2月28日美以联合空袭德黑兰，这场斩首行动直接改写伊朗政局。伊朗专家会议成员海达里向阿拉比电视台披露一段内部内情：空袭发生时，穆杰塔巴身处最高领袖官邸区域，在爆炸中负伤。
美以情报获知他被送往医院救治后，接连轰炸德黑兰多家医疗机构，穆杰塔巴身处其中一家被炸毁的医院，最终被救援人员从废墟之中抢救出来，侥幸活了下来。需要说明，医院定点追杀的细节属于海达里单方面披露，没有得到伊朗官方确认，美以方面对此予以否认。
世界卫生组织此前确认，空袭期间伊朗境内有多起针对医疗设施的袭击事件，造成多名医护人员伤亡，但各方并未公开解释医院遭袭背后的完整缘由。空袭当中，阿里·哈梅内伊以及穆杰塔巴的妻子、儿子与多名军方高官遇难。
伊朗驻塞浦路斯大使接受外媒采访时表示，穆杰塔巴手部、手臂、腿部多处受伤，能够存活实属万幸。伊朗卫生部门的救治记录显示，穆杰塔巴于2月28日下午送入医院，主要为头面部、腿部浅表外伤，完成缝合后，在3月1日凌晨便转移至隐蔽安全据点，院内救治仅持续十三个小时，与海达里讲述的废墟逃生版本存在明显出入。
战火也冲击了伊朗的权力交接机制。负责推选最高领袖的专家会议秘书处大楼遭到轰炸，多名工作人员遇难，大量继任人选相关档案在大火中焚毁。原定的公开会议无法举行，数十名宗教学者只能在严密安保下秘密集会投票。
59名参会成员中，穆杰塔巴拿到50票，成功当选新任最高领袖。按照海达里的说法，当时穆杰塔巴还处于避险状态，事先并不知晓选举进程，直到官方发布公告，才得知自己已经成为战时伊朗最高领袖 。
这次选举背后，也夹杂着外部干预带来的逆反心态。海达里本人正是穆杰塔巴的提名者。美方此前公开表态不希望穆杰塔巴出任最高领袖，这番施压反而刺激了伊朗内部的情绪。
参会人员形成共识，不能任由外部势力干涉本国最高领导人的遴选，这也成为穆杰塔巴高票当选的重要因素。战争环境下的权力更替，既受内部体制约束，也被外部军事打击深刻影响。
就任之后，穆杰塔巴长期保持神秘状态，外界围绕他的身体状况议论不断。伊朗官方多次表态其身体状况正常，伊朗总统佩泽希齐扬也证实，二人曾进行长达七小时的闭门会谈，以此佐证他正常履职。
但路透社援引伊朗内部消息称，空袭给他留下难以修复的面部伤痕，需要长期休养。自3月履职至今，伊朗官方没有对外发布穆杰塔巴的全新公开照片，这也进一步放大外界的猜测。
之所以保持高度隐秘，一方面是空袭带来的身体损伤，更关键是严峻的安全威胁。医院遇袭的内情曝光之后，外界才意识到对手可以精准锁定他的行踪。
如今穆杰塔巴尽量减少公开露面，严控影像流出，会面地点不断更换，只有极少数核心高层能够当面议事，多数指令依靠亲笔手令或者特使口头传递，最大限度规避被情报机构定位的风险。
不过领导人长期隐身，同样潜藏现实隐患。普通民众、基层官员、军队中层很难见到最高领袖本人，各类流言容易滋生。以色列也完全有可能抓住这一点，借机炒作舆论，搅动伊朗内部社会情绪。战争带来的生存危机已经过去，但如何平衡安全保密与国家治理的公开性，是穆杰塔巴必须面对的长期难题。