今天是2026年的第一天,在此先祝大家:新年快乐!在2026年身体健康,万事如意!在2025年的最后一天,也就是12月31日,北京大学刘君带领团队与合作者以“Resource”的形式在顶刊Cell发表了最新成果。该研究报道了FOCAS:通过全转录组单m⁶A位点筛选功能解析表观转录组在癌症基因表达中的调控机制。
尽管N⁶-甲基腺苷(m6A)是一种普遍存在的RNA修饰,对基因调控至关重要,但逐个解析单个m6A位点的功能在技术上仍极具挑战。为此,该研究开发了FOCAS(Functional m6A sites detection by CRISPR-dCas13b-FTO screening)——一种基于CRISPR-dCas13b的高通量、位点特异性m6A功能筛选平台。在四种人类癌细胞系中应用FOCAS,共鉴定出4475个受m6A调控并影响细胞适应性的基因,这些基因涵盖mRNA 与非编码RNA(ncRNA),其中许多首次被关联至癌症,并表现出动态的发育表达特征。FOCAS揭示了同一基因内部m6A的上下文依赖性和阅读蛋白特异性效应,展现了其精细的调控逻辑。
此外,研究发现了通用与细胞类型特异的m6A模式:独特位点富集于 ncRNA,通用位点则富集于转录相关基因。在SMMC-7721细胞中,研究进一步解析了受m6A调控的转录网络,显示出广泛的表观转录组-转录组交互。总体而言,该研究建立了一种强大且无偏好的m6A功能解析方法,实现了对单个m6A位点的功能解析,深化了对其复杂性和癌症治疗价值的理解。据了解,该研究于2024年8月向Cell投稿,文章在2025年11月27日被正式接受,如今在2025年最后一天在线发表。
本研究第一单位为北京大学,共同第一作者为张薪泞、张艺凡和刘欣宇。本文也是北京大学2025年发表的最后1篇CNS正刊;2025年在CNS上的发文表现亮眼,据初步统计,北京大学全年以第一单位共发表了36篇CNS正刊,其中16篇Nature、11篇Cell和9篇Science,稳居国内高校第一;也刷新了北京大学CNS发文的历史新高(超过了去年的29篇)!
特别是在今年上半年,北京大学便发表了“惊人”的29篇CNS,曾较长时间占据今年全球高校CNS 发文榜第三的位置(下半年国内清华大学发文最多),详见:太强!北京大学上半年发表近30篇CNS顶刊和多篇数学四大顶刊文章,均居国内第1。经过今年下半年的调整,2026年上半年可能又会进入“爆发期”,我们也可以看一下是否如此。
本文唯一通讯作者为刘君,她分别于2010年和2015年在北京大学取得学士和博士学位。博士毕业后她前往美国芝加哥大学进行博士后研究,合作导师为著名华人科学家,RNA表观遗传学领域开创者之一的何川。2020年,她回国加入母校北京大学至今,目前为该校生命科学学院/北大清华生命科学联合中心研究员。刘君的主要研究方向为RNA表观转录修饰与非编码RNA(ncRNA)的分子调控机制及其生物学功能等;她曾获拜尔学者、国家“优青”(海外)和亚洲青年科学家基金等荣誉。
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