王培君1992年7月毕业于河海大学并留校工作，历任河海大学校长办公室综合科科长、保卫处处长助理、团委副书记、团委书记等职。其中，1997年4月至1998年5月在水利部办公厅交流工作，2000年1月至2001年1月参加江苏省委驻盱眙扶贫工作队。
2008年6月，王培君任江苏省教育科学研究院、江苏教育学院副院长，2012年7月任南京林业大学党委常委、副校长，2017年6月任南京林业大学党委副书记。
2022年8月，王培君调任常熟理工学院党委书记。2025年3月，常熟理工学院正式更名为苏州工学院，王培君任苏州工学院党委书记，至此番履新。