SCLS专题 | 单细胞组学分析:方法和应用

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单细胞技术使我们能够在单个细胞的尺度上深入探索多种生物层次,显著提升了我们对细胞多样性、组织结构和整体生物体功能的理解。自2009年首次开发以来,单细胞测序技术被广泛应用于解析基因表达模式和揭示转录程序。随着技术的迅速发展,单细胞方法已扩展至涵盖其他组学领域,如基因组学、表观基因组学、蛋白质组学和代谢组学。此外,包括空间转录组学和单细胞水平CRISPR筛选在内的多模式技术进一步增强了我们全面了解细胞状态的能力。单细胞技术不仅加深了我们对多种疾病机制的认识,如癌症、发育障碍和与衰老相关的疾病,还为相关研究提供了新的视角。

Science China Life Sciences 2025年第1期出版“单细胞组学分析:方法和应用”专题(Genome editing technology and medical applications),重点关注与单细胞方法相关的主题,内容涵盖以下四个方面:(1) 单细胞多组学测序技术;(2) 单细胞空间技术;(3) 单细胞CRISPR筛选技术;(4) 单细胞技术的应用。

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 特邀编辑 

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石铁流  教授

华东师范大学生命科学学院

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刘琦  教授

同济大学生命科学与技术学院

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范骁辉  教授

浙江大学药学院

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王晨飞  教授

同济大学生命科学与技术学院




专题篇目

 Editorial 

Single-cell technologies: current and near future

Chenfei Wang, Qi Liu, Xiaohui Fan, Tieliu Shi

Volume 68, Issue 1, 2025, Pages 1-4


 Reviews 

Single-cell omics: experimental workflow, data analyses and applications

Fengying Sun, Haoyan Li, Dongqing Sun, Shaliu Fu, Lei Gu, Xin Shao, Qinqin Wang, Xin Dong, Bin Duan, Feiyang Xing, Jun Wu, Minmin Xiao(肖敏敏)*, Fangqing Zhao(赵方庆)*, Jing-Dong J. Han(韩敬东)*, Qi Liu(刘琦)*, Xiaohui Fan(范骁辉)*, Chen Li (李辰)*, Chenfei Wang(王晨飞)*, Tieliu Shi(石铁流)*

Volume 68, Issue 1, 2025, Pages 5-102

单细胞组学技术、数据分析与应用
19位学者联合撰写98页长篇综述,从8个方面全面总结了过去10年中单细胞组学技术的最新进展、数据分析方法及其在生物医学领域的广泛应用。


 ResearchPaper 

Resolving the developmental mechanisms of cardiac microthrombosis of SARS-CoV-2 based on single-cell transcriptome analysis

Xizi Luo, Nan Zhang, Yuntao Liu, Beibei Du, Xuan Wang, Tianxu Zhao, Bingqiang Liu, Shishun Zhao, Jiazhang Qiu(邱家章)*, Guoqing Wang(王国庆)*

Volume 68, Issue 1, 2025, Pages 103–115

单细胞测序分析揭示SARS-CoV-2感染后患者心脏微血栓形成机制

该研究揭示了病毒感染引起凝血功能障碍形成的分子机制,为炎性血栓治疗靶点提供理论基础。


Dissecting the cell microenvironment of ovarian endometrioma through single-cell RNA sequencing

Jiangpeng Wu, Siyu Xia, Wenting Ye, Yan Sun, Jing Cai, Fubing Yu, Haiping Wen, Xiuwei Yi, Taikang Li, Mingwei Chen, Jiayun Chen, Ge Song(宋革)*, Chuanbin Yang(杨传彬)*, Yali Song(宋亚丽)*, Jigang Wang(王继刚)*

Volume 68, Issue 1, 2025, Pages 116-129

卵巢子宫内膜异位症的细胞微环境解析

该研究系统描绘了卵巢子宫内膜异位症相关的细胞类型比例和分子特征,揭示了特异性细胞类型在其发病过程中的潜在机制。