划重点
01西湖大学雷凯团队在Nature Communications杂志上发表了一项关于线粒体形态动态变化调控涡虫个体再生的研究。
02研究发现线粒体动力学平衡不仅影响干细胞的多能性，还决定细胞的命运选择和组织再生。
03通过精确调控线粒体动态平衡，可能在一定程度上促进组织再生。
04该研究揭示了在个体再生过程中维持线粒体动力学的重要性，为利用涡虫体系研究损伤后再生奠定了基础。
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组织再生，尤其是个体再生，是一个复杂的动态过程，涉及损伤后的响应及干细胞的增殖和分化。这一过程需要精确协调组织内细胞的命运及其在再生过程中的位置控制信息。多种信号通路，如Wnt和ERK，在不同物种中高度保守，对再生过程起着关键作用。
在再生过程中，细胞代谢活动和能量需求显著变化。线粒体作为细胞的能量工厂和信号中枢，在发育、伤口愈合及干细胞命运决定中发挥着重要作用。线粒体的动力学平衡和代谢状态对这些过程至关重要。
具体而言，线粒体的分裂和融合、质量控制以及能量产生，都在再生过程中调节细胞的功能和命运。尽管已有研究表明线粒体在组织再生中具有重要作用，但其具体机制仍不完全清楚。特别是线粒体动力学在个体再生中的功能及其作用机制，仍知之甚少。
北京时间2024年12月13日，雷凯团队在Nature Communications杂志上在线发表了题为“Mitochondrial Dynamics Govern Whole-body Regeneration Through Stem Cell Pluripotency and Mitonuclear Balance”的研究成果。
该研究揭示了线粒体动力学平衡对于维持正常再生功能的重要性。研究发现线粒体动力学平衡不仅影响干细胞的多能性，还决定细胞的命运选择和组织再生。这一发现提示，通过精确调控线粒体动态平衡可以在一定程度上促进组织再生。
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古有皇帝炼丹求长生不老，西游记里，孙悟空拔一根毫毛，吹出猴万个。希腊神话中，普罗米修斯的肝脏每晚被吃掉，每天又重新长出来。这些故事听起来像极了幻想，但在自然界中，类似的奇迹确实存在。涡虫，这种神奇的生物，拥有科幻大片中才有的“超能力”——再生，无论你如何切掉它的组织块，它都能再生成一个完整的个体，真正做到“满血复活”。这种神奇的能力吸引了无数科学家的目光，其中包括西湖实验室的雷凯研究员。雷凯在博士后期间就被涡虫的再生能力所吸引，开启了与涡虫的缘分，并于2018年入职西湖实验室，其课题组成为国际上研究涡虫再生过程的20多个实验室之一。
2019年，雷凯课题组刚刚成立不久，了解到北京大学的陈良怡和陈知行团队在线粒体成像仪器和探针技术上取得了突破性的创新。经过讨论和尝试，三个团队决定联手利用先进的成像技术和新型线粒体荧光探针，探索涡虫再生的调控机制。从微观的线粒体到宏观的涡虫再生，每一个细节都充满了探索的乐趣和挑战。这场科学冒险不仅汇聚了前沿的知识和技术，更融合了不同领域的智慧和创造力。
研究团队选择具有强大个体再生能力的地中海圆头涡虫（Schmidtea mediterranea）作为研究对象，该物种体内含有约20%的成体多能干细胞。那么作为我们熟知的能量代谢中心线粒体，真的可以特异的参与到个体再生过程吗？带着这个问题，研究团队通过RNA干扰（RNAi）手段筛选并发现敲降opa1基因，破坏线粒体融合。研究团队发现这并不会导致涡虫死亡，而是导致涡虫的再生能力显著受损，不能再生神经和肠道等复杂组织结构。恢复线粒体的形态动态平衡后，再生缺陷得到有效挽救。这一结果提示，线粒体动态平衡参与涡虫个体再生（图1）。
图1. 敲降线粒体形态动态平衡基因后再生第七天的涡虫形态
为了进一步探究线粒体形态变化对涡虫再生及干细胞的影响，研究团队使用线粒体染料PK Mito Red将涡虫体内的多能干细胞（4N）根据线粒体状态分为Mitolow和Mitohigh细胞。Mitolow细胞具有长管状的线粒体形态，且细胞多能性更强；而Mitohigh细胞则具有短棒状的线粒体形态。定量分析连续再生时间点的流式分析数据显示，Mitolow细胞的比例在损伤再生后12小时达到峰值，而Mitohigh细胞比例先下降，然后在12小时后增加，在再生后3天达到峰值。在涡虫再生过程中，成体多能干细胞通过过度增殖对损伤作出反应，分别在6小时和48小时出现两个增殖高峰。Mitolow和Mitohigh细胞在12小时和3天的峰值比例可能是成体多能干细胞大量增殖和分化的结果。
这些观察结果提示，线粒体形态的变化可能与涡虫在个体再生过程中细胞命运状态的变化密切相关。破坏这种长管状的线粒体形态会降低涡虫成体干细胞的多能性，从而导致这些干细胞在再生过程中无法响应损伤引发的细胞增殖和分化程序，进而阻碍下游再生过程（图2）。
图2. 不同细胞类型中的线粒体形态变化
那么线粒体形态及其代谢过程具体如何参与个体再生过程呢？研究团队发现，敲降编码线粒体融合蛋白的基因opa1后，线粒体的动态平衡被破坏，进而影响干细胞的命运决定。具体而言，敲降opa1后，代谢相关基因和线粒体蛋白编码基因的表达模式发生显著变化，合成代谢受到阻碍，未折叠蛋白反应（UPR）过度激活。
为进一步探索受线粒体动态平衡调控的下游再生信号，研究团队对受opa1影响的基因进行了系统注释和RNAi功能筛选。结果显示，这些下调基因中包含再生所必需的损伤诱导基因fos1。此外，敲降线粒体核糖体相关蛋白编码基因MRPL2和复合物III蛋白编码基因UQCR10后，再生过程受到阻碍，表型与opa1 RNAi涡虫相似。这些结果提示，线粒体动力学可能通过细胞核-线粒体信号平衡调控涡虫个体再生过程（图3）。
图3. 总结转录组学数据中受opa1影响的差异表达基因
基于以上发现，研究团队提出了一种概念模型：在涡虫再生过程中，线粒体动力学平衡是维持正常再生功能的关键。这一平衡不仅影响干细胞的多能性，还决定了细胞命运的选择和再生效率。研究提示，通过精确调控线粒体动态平衡可以在一定程度上促进组织再生（图4）。
图4. 研究模式图
该研究揭示了在个体再生过程中维持线粒体动力学的重要性，并拓宽了线粒体在响应损伤及再生信号传递中的功能。这一发现为利用涡虫体系研究损伤后再生，尤其是个体再生及干细胞命运决定中的线粒体和代谢调控机制奠定了基础。
组织再生的研究不仅为治疗各种疾病提供了新的希望，也为理解生命科学的基本原理开辟了新的途径。通过结合现代生物技术和对自然界中这些神奇现象的深入研究，科学家们有望开发出更有效的治疗方法，甚至可能延长人类的寿命。未来，我们或许能够见证一个新时代的到来，那时人类不仅能够治愈疾病，还能够延缓衰老，实现真正的健康长寿。
西湖大学特聘研究员雷凯，北京大学教授陈良怡、陈知行为本文共同通讯作者。西湖大学博士研究生潘雪、赵芸、李玉聪为本文共同第一作者。西湖大学博士研究生陈佳佳、张文娅、熊周元一、应雨晴、徐昊、孙宇涵，科研助理张玉红，西湖大学高性能计算中心李南、杨凌，浙江大学城市学院副研究员高充对本项工作提供了重要帮助。本课题得到了北京大学助理教授黄小帅的帮助。西湖大学高性能计算中心、冷冻电镜平台、基因组平台、显微成像平台、流式平台、质谱与代谢平台、公共仪器与洗消供应平台等多平台为课题的顺利进行提供了保障。
雷凯团队致力于再生与干细胞生物学的研究。通过涡虫、类器官及小鼠模型，探索涡虫再生、神经退行性疾病等生物学问题。实验室欢迎具备但不限于细胞、分子生物学、生物信息学以及化学生物学背景的博士后、研究助理和博士研究生加入。
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