由于红薯中含糖较多，空腹食用时，容易刺激胃酸的大量分泌，易引起腹部不适。另外，其所含纤维较多，容易引起腹胀和排气增多。
因为生红薯中淀粉的细胞膜未经高温破坏，人体很难消化。同时，在煮红薯时，还应适当延长蒸煮的时间，这样更加有利破坏红薯中所含有的“气化酶”，吃后才不会出现腹胀、烧心、打嗝、反胃、排气等不适感觉。
以下几类人群尽量少吃红薯：
一是有草酸性肾结石的人，因为红薯含有大量的。
二是慢性胃病、反流性食管炎和胃溃疡的人不要食用红薯，防止引起吐酸水和烧心感，使病情加重。
三是的人不要食用红薯，防止引起腹部不适，甚至腹泻。
因为红薯皮中含碱较多，食用过多会引起胃肠不适。呈褐色或有黑褐色斑点的红薯皮更不能吃，因为这种红薯已经受到了黑斑病菌的感染，人食用后易造成肝脏损伤，并引起中毒。
中毒轻者会出现胃部不适、恶心、呕吐、腹泻、食欲下降、乏力等症状，严重者可导致头痛、高热、气喘、抽搐、吐血、昏迷，甚至死亡等。