《战锤40K：星际战士2》虽然讲了一个有头有尾的故事，但是对于玩家来说这远远不够，官方的内容更新又是按季度推出。为了游戏新鲜感，mod自然就是玩家们最好的选择。各种奇妙的“忠诚与异端玩意儿”都出现在了线上战斗中。不过开发商Saber Interactive正式宣布12月起将禁止在公开匹配游戏中使用mod，但是官方将推出mod支持，可以让玩家在私人匹配游戏中使用这些mod内容。
Saber Interactive称他们一直都希望打造一款更加支持mod制作的游戏，因为mod可以延长游戏的生命力，所以《战锤40K：星际战士2》的游戏文件并没有加密。不过为了游戏的稳定性，自12月《战锤40K：星际战士2》的大更新开始将禁止公共在线服务器使用。因为Saber Interactive收到用户报告称与使用mod的玩家联机后，存档出现损坏。不过玩家依旧可以在私人匹配游戏中使用，同时官方也提供特定接口与mod开发工具，让玩家不会因为游戏更新而导致mod失效。