基因检测让致病微生物“无处遁形”

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划重点

01加州大学旧金山分校的科研团队开发了先进的宏基因组二代测序技术,可快速检测、识别人体内几乎所有种类的致病微生物。

02该技术最初被用于识别脑脊液中的病原体,如今已调整至识别呼吸道液体中可能引发肺炎的病原体。

03由于此技术采用“简单粗暴”的分析方法,只需30分钟操作,后续工作可交给机器人和人工智能完成。

04宏基因组二代测序技术在2014年引起轰动,成功挽救了15岁美国少年乔舒亚·奥斯本的生命。

05该技术有望成为全球应对下一次疫情的技术基础,可在不到一天时间内检测出新冠病毒、流感病毒等呼吸道病毒。

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       参考消息网11月15日报道 据美国健康生活新闻网11月12日报道,科研人员表示,一种先进的基因检测方法可以快速检测、识别人体内几乎所有种类的致病微生物,无论是病毒、细菌、真菌还是寄生虫。

美国加利福尼亚大学旧金山分校的科研团队在十多年前开发了这项技术,此后这种基因检测方法便被用来识别脑脊液中的病原体。

如今,科研人员调整了检测技术,以便识别呼吸道液体中可能引发肺炎的病原体。这一最新研究成果发表在11月12日出版的英国《自然-医学》杂志上。

这项检测技术被称为“宏基因组二代测序”。据介绍,科研团队这次还实现了该技术的自动化操作。

科研团队表示,新的呼吸系统版本宏基因组二代测序只需进行30分钟操作,就可以把后续工作交给机器人和人工智能。新技术还可以及时得出检测结果,便于治疗危险的感染。

新闻通稿援引美国加利福尼亚大学旧金山分校的实验室医学与传染病学教授、高级研究员查尔斯·邱(音)的话说:“我们的目标是在12小时到24小时内完成整个流程,能够当天或者第二天出结果。”

宏基因组二代测序技术采用了一种“简单粗暴”的分析方法。

这项技术不会逐一寻找单个类型的病原体,而是分析样本中所有的核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA),然后把人类遗传物质与来自细菌、病毒、真菌或寄生虫的遗传物质分离开来。

查尔斯·邱说:“我们的技术乍看之下很简单。通过用单次检测取代多次检测,我们可以为感染的诊断与治疗节省漫长的猜谜过程。”

宏基因组二代测序技术首次引起轰动是在2014年。有医生利用这项技术挽救了15岁美国少年乔舒亚·奥斯本的生命。奥斯本当时深受严重的头痛、发烧、体重骤降和疲劳感的困扰。

他最终患上严重的脑炎,陷入了昏迷——但医生依然没有找到致病原因。医学检查与脑部活检都没有发现病因。

然后,有科研人员利用宏基因组二代测序技术,在48小时内找到了病因。

罪魁祸首原来是圣地罗西钩端螺旋体,一种源于波多黎各的细菌。事实证明奥斯本曾在入院的一年前与家人前往波多黎各参加教会夏令营。原来这种折磨了他一年多的病症只需传统的青霉素就能治好。

从2016年到2023年,美国加利福尼亚大学旧金山分校的科研团队利用宏基因组二代测序技术分析了近5000份脑脊液样本,其中超过14%的样本被证明存在感染。

科研团队在最新论文中写道,总的来讲,这项技术识别脑脊液中病原体的准确率为86%。

基于上述研究成果,科研团队调整了检测方法,使其能够快速检测呼吸系统疾病,有望成为全球应对下一次疫情的技术基础。

最新论文显示,宏基因组二代测序技术可以在不到一天时间里检测出新冠病毒、流感病毒、呼吸道合胞病毒等呼吸道病毒,哪怕样本中的病毒含量微乎其微。对于未来可能出现的新毒株,这项技术应该也可以检测出来。(编译/刘子彦)