【导读】最近的研究强调了免疫反应的表观遗传调节，然而，RNA N6-甲基腺苷（m6A）对于头颈部鳞状细胞癌（HNSC）的修饰和免疫调节，仍未被探索。
2024年10月26日， 中南大学附属湘雅三医院Gao Ru团队在期刊《Heliyon》上发表了题为“The m6A and immune regulatory gene signature predicts the prognosis and correlates with immune infiltration of head and neck squamous cell carcinoma”的研究论文。研究结果证实，与 m6A相关的聚类亚群、风险模型和免疫调节基因，预示着HNSC的不良预后。风险评分成为HNSC患者的有效预后生物标志物和预测指标。
https://www.cell.com/heliyon/fulltext/S2405-8440(24)15789-1#au4
关于头颈部鳞状细胞癌
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头颈部鳞状细胞癌（HNSC）在全球最普遍的恶性肿瘤中排名第六。尽管在过去30年中，HNSC的存活率略有提高，但这种情况造成了深远的损失，严重影响了患者的身心健康。传统的诊断和治疗方法，对早期疾病检测和预后增强构成挑战。
近年来，多项研究揭示了m6A和免疫调节之间的独特关系改良。这种相互作用包括T细胞增殖和分化的修饰、必需宿主转录物周转的调节以及甲基化病毒转录物，以促进宿主免疫系统的逃避。
本研究利用癌症基因组图谱（TCGA）数据库，研究与m6A调节因子和免疫调节相关差异表达基因（M6A&IMRDEGs）介导的甲基化修饰相关的生物学功能和网络，旨在阐明M6A&IMRDEGs在HNSC患者预后中的作用。
头颈部鳞状细胞癌预后风险模型的分析
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与低风险组相比，高危组的预后较差。团队观察到风险水平与3个临床因素（性别、年龄和M阶段）之间存在统计学上的显著关联。M阶段在预后风险模型中，表现出比其他变量更高的效用，而Gender表现出较低的效用。预后风险模型在1年>3年>5年时，表现出优异的临床预测效果。
预后分析
免疫浸润分析
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高危组和低危组之间各种免疫细胞的表达水平差异有统计学意义，包括活化的B细胞、活化的CD4 T细胞、活化的CD8 T细胞、效应记忆CD8 T细胞、未成熟B细胞、记忆B细胞、滤泡状T辅助细胞、1型T辅助细胞、17型T辅助细胞、2型T辅助细胞、 活化的树突状细胞、嗜酸性粒细胞、未成熟树突状细胞、巨噬细胞、MDSC、单核细胞、自然杀伤T细胞和中性粒细胞。在高危组中，团队观察到MUC5B与活化的树突状细胞之间存在显著的正相关；而在低风险组中，SCGB3A1与活化的CD4 T细胞呈显著负相关。
通过ssGSEA算法，进行风险组免疫浸润分析。
总结
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1. 研究发现29个m6A和IMRDEG（免疫调节相关基因）的差异表达，并通过GO、CNV、SNP评估和WGCNA分析，鉴定出与HNSC预后相关的基因，如IL11和MMP13。
2. 通过PPI分析，确定7个与m6A修饰和免疫调节有关的中心基因，包括BPIFB1、BPIFB2、GP2、MUC5B、MUC7、PIP和SCGB3A1。
3. 高危组和低危组之间存在18种免疫细胞类型的表达水平差异，表明风险模型可以评估肿瘤的免疫状态并预测治疗结果。
4. 确定了9个关键基因（HTN1、ZG16B、HMGA2、GAST、LYZ、CSF2、MB、MAGEB2和TAC1）构建的风险评分，与HNSC患者的性别、年龄和M分期相关，是预后不良的独立危险因素。
5. 研究还发现与HNSC发生和发展相关的DEGs（差异表达基因），主要与细胞外基质（ECM）结构和免疫反应有关。
6. 研究提供了HNSC中M6A&IMRDEGs的全面调查，并开发了相关的预后风险模型，有助于识别肿瘤的免疫表型，为个性化癌症免疫治疗提供新见解，但需要进一步验证。
参考资料：
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New developments in the management of head and neck cancer – impact of pembrolizumab
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