癌症免疫治疗再创突破
1. Nature｜樊荣/唐力团队同期二连发，癌症免疫治疗再创突破！Type-1 免疫被视为抗肿瘤的主要免疫应答类型，而 Type-2 免疫在肿瘤发生、发展与治疗中的作用更为复杂，常与免疫抑制微环境相关并促进肿瘤生长。尽管如此，越来越多的研究显示 Type-2 免疫也可能抑制肿瘤发展。目前关于 Type-2 免疫与癌症治疗关系的临床研究仍较为匮乏。2024 年 9 月 25 日，美国耶鲁大学樊荣教授组和瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）唐力教授组在同一期 Nature 上发表论文 Single-cell CAR T atlas reveals type 2 function in 8-year leukaemia remission 和 The type 2 cytokine Fc–IL-4 revitalizes exhausted CD8+ T cells against cancer。耶鲁大学白志亮博士和 EPFL 冯兵博士为两篇文章的共同第一作者。第一项研究针对接受 CD19 CAR-T 治疗的儿童 B-ALL 患者，利用单细胞多组学测序技术，揭示了 Type-2 免疫在 CAR-T 治疗后的功能特征及其与长期无癌生存之间的关系。研究结果显示，维持超过 8 年临床缓解的患者中，Type-2 CAR-T 细胞的比例显著高于其他患者。这一发现挑战了传统观点，指出在特定情况下，尤其是血液肿瘤中，Type-2 免疫对 CAR-T 疗法的持久性具有重要作用。第二项研究聚焦于新型 Type-2 细胞因子 Fc-IL-4 的开发与应用。研究发现，Fc-IL-4 与现有的 CAR-T 疗法及免疫检查点抑制剂联合使用，显著增强了多种实体肿瘤的清除效果。在黑色素瘤和结肠癌等多个实验模型中，Fc-IL-4 与 Type-1 免疫疗法协同作用，诱导了持久的抗肿瘤免疫反应。这项研究不仅展示了 Type-2 免疫因子在提高抗癌效果方面的潜力，还揭示了 Type-1 和 Type-2 免疫并非对立，而是可以发挥有效协同作用。这两项研究得出了一致且相互支持的结论：Type-2 免疫在肿瘤免疫治疗中具有积极作用。分别通过聚焦于长达十年患者长期临床追踪以及临床前机理研究，得出了 Type-2 免疫在维持长期抗癌免疫中起到关键作用的结论。2. Cell｜樊荣团队开发全球首个临床级 FFPE 样本空间全转录组测序技术在福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织中空间探索 RNA 生物学的能力为组织病理学研究带来了变革性潜力。2024 年 9 月 30 日，耶鲁大学樊荣团队在 Cell 上发表论文 Spatially exploring RNA biology in archival formalin-fixed paraffin-embedded tissues。白志亮博士等为第一作者。研究人员通过结合原位多聚腺苷酸化和空间全转录组测序的计算创新，提出了病理兼容的组织确定性条形码 (Patho-DBiT)，专门用于探测临床存档的 FFPE 样本中的各种 RNA 物种。它允许对基因表达和 RNA 处理进行空间共分析，揭示区域特异性剪接异构体，并对存储 5 年的临床肿瘤 FFPE 组织进行高灵敏度转录组图谱分析。此外，它还可以捕获全基因组单核苷酸 RNA 变体，以区分人类淋巴瘤中的恶性亚克隆和非恶性细胞。Patho-DBiT 还映射了 microRNA 调控网络和 RNA 剪接动力学，解码了它们在空间肿瘤发生中的作用。单细胞水平的 Patho-DBiT 剖析了驱动肿瘤克隆结构和进展的时空细胞动力学。Patho-DBiT 有望成为一个有价值的平台来揭示 FFPE 组织中丰富的 RNA 生物学，帮助进行临床病理学评估。