Nature一周论文导读|2024年8月29日

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划重点

01《自然》杂志发表了多篇文章,涉及信号传导与顺式调控元件活动、肠道微生物群致癌物代谢、太空飞行对人体生物学的改变等多个领域。

02一项研究发现线粒体内膜嵴可以回收局部损伤,去除受损褶皱,为线粒体功能障碍的诊断和治疗提供新目标。

03另一项研究揭示了肠道微生物在癌症发展过程中的作用,以及环境分子在进入体内后致癌的一条全新通路。

04此外,研究还发现系外行星WASP-39b的大气明暗交界区域是非均质的,夜晚的明暗交界区域温度高于早上的区域温度。

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审校 小勺 小冰 小象

制版 阿金


生物学

Biology


Symbolic recording of signalling and cis-regulatory element activity to DNA

将信号传导与顺式调控元件活动以符号形式记录到 DNA 中



The genomic basis of childhood T-lineage acute lymphoblastic leukaemia

儿童 T 系急性淋巴细胞白血病的基因组基础



Neural circuit basis of placebo pain relief

安慰剂缓解疼痛的神经环路机制



A spatial expression atlas of the adult human proximal small intestine

人类成体近端小肠的空间表达图谱



Lysosomes drive the piecemeal removal of mitochondrial inner membrane

溶酶体驱动线粒体内膜碎片化去除


(导读 才生)线粒体内膜嵴作为独立的生物能量单位,经历快速和短暂的重塑,但这种分隔组织的意义尚不清楚。本研究利用超分辨率显微镜发现了线粒体修复所依赖的一种新循环机制:线粒体可以回收局部损伤,去除被称为嵴的受损褶皱,嵴中含有产生能量所需的蛋白质和分子。结果表明这一机制的发现可以为线粒体功能障碍的诊断和治疗提供新目标。[相关报道:精准修复受损线粒体,《自然》研究发现新机制]


Cultivation and visualization of a methanogen of the phylum Thermoproteota

嗜热变形菌门产甲烷菌的培养和可视化


(导读 阿金)了解甲烷的来源与沉积对微生物学、生物地球化学、气候科学等诸多领域都有重要意义。本研究报告了来自陆地温泉泉古菌门(Thermoproteota)内一微生物类群 Methanomethylicia 成员:热蛋白菌门 Candidatus Methanosuratincola verstraetei 菌株 LCB70 的培养成果,证明这类嗜热古菌通过甲基还原氢营养甲烷生成的方式生长。而低温电子断层扫描揭示了 Ca. M. verstraetei 是拥有古菌与化学受体阵列的球状细胞,可形成细胞间“桥梁”以连接两到三个具有连续细胞质与S层的细胞。结果表明这类微生物可能对不同缺氧栖息地内的碳循环发挥重要作用。[论文详细信息]


Isolation of a methyl-reducing methanogen outside the Euryarchaeota

分离广古菌外的甲基还原产甲烷菌


(导读 领研网)产甲烷古菌在地球生命起源进化、全球气候变化和碳素循环中起着重要作用。本研究利用自主研发的鸡尾酒分离法,首次分离获得佛斯特拉门古菌纯培养物(LWZ-6),并证实了该古菌具有氢依赖代谢甲基类物质产甲烷的生理功能,但不具有发酵生长能力。该结果将为研究全球碳循环机理和低碳技术研发提供新型生物资源基础。[论文详细信息]


Gut microbiota carcinogen metabolism causes distal tissue tumours

肠道微生物群致癌物代谢导致远端组织肿瘤


(导读 领研网)癌症的发生与众多因素有关,从分子层面可能来自各种基因突变或者基因损伤。本研究发现肠道内部原本和谐共处的肠道菌群竟然会成为促癌帮凶,它们将特定外界污染物代谢后,会产生出新的促癌物质散播到组织中,提升癌症发生风险。通过关注膀胱癌的发生过程,发现肠道是促癌氧化代谢产物 BCPN 最大的生产基地,多种不同的肠道菌亚群对 BBN 的氧化有促进作用。该结果揭示了肠道微生物在癌症发展过程中的作用,以及环境分子在进入体内后致癌的一条全新通路。[相关报道:“坏人”在内部,肠道菌这次坏事了!《自然》发现它们能加工促癌分子,远程诱发癌症]


The Space Omics and Medical Atlas (SOMA) and international astronaut biobank

空间组学和医学图谱和国际宇航员生物库


(导读 才生)太空飞行会诱导宇航员体内发生分子、细胞以及生理变化,挑战人体生物医学。本研究报告了人类生物学“空间组学和医学图谱”(SOMA),发现 SpaceX 的“灵感 4 号”任务进行的短期低地轨道太空飞行带来广泛的分子变化,其中一些与长期飞行的效果一致,包括细胞因子水平升高、端粒延长,以及免疫激活、DNA 受损反应和氧化应激的基因表达改变。[论文详细信息]


Molecular and physiological changes in the SpaceX Inspiration4 civilian crew

SpaceX“灵感 4 号”平民机组人员的分子和生理变化


(导读 才生)本研究报告了 SpaceX 灵感 4 号的数据,4 名平民宇航员在地球上空 590 公里飞行了 3 天,这一位置高于国际空间站。这项任务采用了新的太空飞行硬件和诊断设备。结果发现,短期任务没有给机组人员带来重大健康风险,并且还描述了人体在解剖学、细胞、生理和认知层面适应宇宙飞行的最初阶段。[论文详细信息]


FANCD2–FANCI surveys DNA and recognizes double- to single-stranded junctions

FANCD2–FANCI 蛋白检测 DNA 并识别双链至单链连接


(导读 领研网)借助尖端的成像技术能在细胞内部以单分子的分辨率看清生物分子复杂和动态的相互作用过程。本研究结合先进的单分子操作工具和可视化工具捕捉到 DNA 损伤修复的生物过程:通过“范可尼修复途径”(FA 途径),参与其中的关键修复蛋白——钳状 D2-I 蛋白并没有直接识别 DNA 双链中“黏”在一起的交联点,而是始终在自由地双向滑动,直到遇上障碍物“滑不动”了才停止。结果表明触发 D2-I 复合物停止滑动并夹在 DNA 上启动修复的原来不是交联的 DNA 本身,而是由于交联而停滞的复制叉内的 DNA 结构。[相关报道:细胞里也有现场解说和慢动作回放了!《自然》新研究,看清 DNA 损伤修复的过程]


Structural switch in acetylcholine receptors in developing muscle

肌肉发育过程中乙酰胆碱受体的结构转变


(导读 领研网)肌肉的发力通过肌纤维收缩来实现,这需要运动神经元对骨骼肌进行控制。对于人类来说,控制骨骼肌收缩的能力并不是一出生就有的。本研究使用冷冻电镜技术获得了肌肉乙酰胆碱受体(AChR)分别在与乙酰胆碱(Ach)结合或不结合时的高分辨率三维结构:从同一个胚胎组织样本中可以同时看到两种版本的 AchR:一种是未成熟的胚胎版本,一种是在成熟神经肌肉接头中的版本。该结果有助于把两种肌肉 AchR 的结构差异与它们的功能差异关联起来。[相关报道:理解肌肉力量的来源,《自然》新研究破解肌肉收缩之谜]


天文学

Astronomy


Black holes regulate cool gas accretion in massive galaxies

黑洞调节大质量星系中冷气体的吸积


(导读 领研网)所有大质量星系的核心都包含一个超大质量黑洞,这些黑洞吸积产生的反馈常被认为对建立大质量星系的静止发挥关键作用。本研究表明揭示了星系中心黑洞的质量是调制星系中原子氢气体含量的最关键的物理量:中心黑洞质量越高的星系其原子氢气体含量越低。而不同类型的星系却遵循同样的冷气体含量-黑洞质量关系。结果表明冷气体含量-黑洞质量关系为研究星系形成演化提供了全新框架。[论文详细信息]


A nebular origin for the persistent radio emission of fast radio bursts

快速射电暴持续发射的星云起源


(导读 小天)目前观测到 24 起快速射电暴(FRB)事件,但只有 FRB1211102 一直在重复发射中。本研究报告 FRB 121102 由一颗被强磁场包围的中子星引起,这个磁场可能是由巨大的黑洞吞噬物质或星云或超新星遗迹内的磁化风产生的。FRB 121102 不仅为天文学家提供了一个更好理解射电暴的机会,也有助于深入了解宇宙中的中子星和磁场。[论文详细信息]


Inhomogeneous terminators on the exoplanet WASP-39 b

系外行星 WASP-39 b 上非均匀的明暗交界


(导读 小天)根据透射光谱对行星大气的探测,科学家认为行星大气明暗交界区域是均质的。本研究报告了系外行星 WASP-39b 的精准轨道参数测量,发现其大气明暗交界区域是非均质的,夜晚的明暗交界区域温度高于早上的区域温度,其碳/氧比率与太阳的一致。通用的行星大气循环模型预测温度差异高峰出现在多云早上的明暗交界区域以及晴朗夜晚的交界区域。[论文详细信息]


地球科学

Geoscience


Earth’s ambipolar electrostatic field and its role in ion escape to space

地球的双极静电场及其在离子逃逸到太空中的作用


(导读 领研网)自 20 世纪 60 年代末以来,飞越地球两极的航天器探测到有一股粒子流从地球大气层流向太空。这股粒子流被称作“极地风”,并且被认为可能是一种尚未发现的电场在起作用。本研究成功测量了地球范围内的电场,该电场控制着极地电离层的结构,可以使电离层高度提升两倍多。该结果有助于了解地球电场是如何随时间的推移,塑造我们的星球以及其他星球的。[相关报道:NASA 测到了寻找已久的地球电场]


Neural general circulation models for weather and climate

天气和气候预测的神经网络环流模型


(导读 领研网)大气环流模式(GCM)通过描述地球陆地、海洋和大气间的一系列物理过程,预测它们如何影响天气和气候。本研究报告了首个能够生成准确集合预报的机器学习模式:NeuralGCM,该模式将传统基于物理规律的模式与机器学习相结合,可以生成中期和短期的天气预报,以及更长期的气候模拟。通过与真实世界数据及其他预报结果进行了对比, NeuralGCM 对 1~15 天预报的准确率能够与欧洲中期天气预报中心的结果相媲美。[相关报道:新 AI 可准确预测天气和长期气候趋势]


材料科学

Materials Science


Superconductivity under pressure in a chromium-based kagome metal

铬基笼目金属在压力下的超导性


(导读 领研网)笼目晶格是一种特殊的六角晶格,理论预测磁性三角(或六角)晶格体系中有可能实现非常规超导电性。本研究首次合成、表征了新型铬基笼目晶格反铁磁体 CsCr3Sb5,并通过压力调控,磁有序或密度波序被逐渐抑制,直至出现超导电性。新发现的铬基笼目超导体 CsCr3Sb5 的 Tc/TF 估算值与典型非常规超导体相当。该结果将有助于解决非常规超导机理问题。[论文详细信息]


On-chip multi-degree-of-freedom control of two-dimensional materials

二维材料的片上多自由度控制



Twist-assisted all-antiferromagnetic tunnel junction in the atomic limit

原子极限内转角辅助的全反铁磁隧道结



其他


【Physics-物理】Observation of the antimatter hypernucleus 

反物质超核的观察


通过几何结构预组织催化 SN2 的新途径


(导读 领研网)本研究报告了小分子氢键供体(HBD)催化剂通过重现酶采用的几何预组织原理来加速对映选择性 Michaelis-Arbuzov 反应的 SN2 步骤。机理和计算结果表明,HBD降低了氯亲核试剂的反应性,但通过将磷鎓阳离子和氯阴离子重组为准备进入 SN2 过渡态的几何结构,加速了决定速率的脱烷基化步骤。这种新的对映选择性 Arbuzov 反应可高对映选择性地获得一系列 H-膦酸酯,以进行多种衍生化。[论文详细信息]


【Robotics-机器人】Passive wing deployment and retraction in beetles and flapping microrobots

甲虫和微型扑翼机器人的翅膀展开和收缩