全国所有的院校行政规格相对统一：本科都是正厅级，专科是副厅级。江苏大学、南京大学和苏州大学都是本科院校，因此单位规格一样都是正厅级，但是具体到学校领导，南京大学的党委书记和校长行政级别要比江苏大学、苏州大学高半格。
一、我国高校的行政架构
按理说，大学是教书育人的殿堂，不应该和行政扯上太多关系。但是我国国情不一样，公立大学被纳入公益二类事业单位范畴，属于体制内单位，学校的管理层和公务员一样按照干部管理权限采取分级管理，设定相应级别，也就是我们常说的职员等级。比如管理二级职员，对应的就是行政副部级；管理三级，对应行政正厅；管理四级，对应副厅；管理五级到十级以此类推，分别对应正处到办事员。
目前，我国高等院校主要分两大类：
一类是本科学院。即以培养本科以上学历为主的高等学府，包括大学和学院，像江苏大学、南京大学、苏州大学都属于这一类。其行政级别按照机构编制部门的三定，统一是正厅级架构。也就是说，本科院校的党委书记、校长的行政级别标配应该都是管理三级职员（正厅级），副职是管理四级职员（副厅级）。因为校领导都是厅级以上干部，按照干部下管一级原则，本科学院的校领导一般都由省管，由省委组织部负责推荐考察。
二是大专学校。特指现行的各类专科类院校。专科类院校三定是副厅级，学校党委书记和校长是副厅级，属于省管干部，书记校长之外的副职则是正处级，接受省教育厅和所在地组织部门双重管理。
因为有组织认定的级别，高校领导可以交流到地方行政机关担任领导职务，置换为公务员身份。这是《公务员法》和《公务员调任规定》明确的。我们经常在媒体看到某某高校领导调任地方担任教育厅长或者省委常委，甚至直接一步到位担任中央部委正职，就是明证。
二、江苏大学、南京大学和苏州大学的校长行政级别一样吗？
熟悉体制的人都知道，单位的行政级别和个人级别有时候并不完全一致。同理，本科院校虽然是正厅级架构，校长理论上都应该是正厅级干部，但实际上因为学校在学科建设上的重要性，一些重点院校是会得到国家的扶持，在各种政策上给予倾斜。表现在干部管理上，就是高配书记和校长的级别。
目前，国内共有31所985、211院校的校党委书记、校长高配了副部，其中就包括清北、人大、哈工大、浙大、南开、川大、南京大学、厦大、兰州大学、大连理工、北京理工、东南大学等知名院校。但不包括江苏大学和苏州大学。
南京大学等这31所高校因此被冠以“中管高校”头衔。这些学校的党委书记和校长都是副部级干部，由中央任免；常务副书记、常务副校长明确正厅，同样列入中组部考察任命，属于中管正厅。其他副职一律是副厅级，按理应由省级组织部门和教育部管理，但近年来为了加强对高校干部的管理，中管高校的副厅级校领导和常务副职一样，都上移权限移交中组部管理。
而江苏大学、苏州大学都是江苏省管院校，受省政府委托由省教育厅代管，其校长的干部任免权限在省委省政府，为正厅级干部，在行政级别上比副部级的南京大学校长要低半格。